|
|
Sekundární metabolity mechorostů
Štěpán, Michal ; Soldán, Zdeněk (vedoucí práce) ; Skýbová, Jana (oponent)
Mechorosty jsou velmi starou skupinou rostlin, které je připisováno prvenství při přechodu rostlin na souš. Aby tento přechod rostlin na souš byl možný, bylo zapotřebí, aby vyvinuly strategie v boji proti různým vnějším faktorů prostředí. A těmito prostředky, pro účinný boj proti boji na souši, jsou různé sekundární metabolity. Je samozřejmé, že tímto vývoj různých ochranných mechanismů neskončil. V podmínkách, v kterých žijí mechy, je zapotřebí bojovat proti různým houbám a bakteriím. V boji s těmito organismy samozřejmě využívají také různých sekundárních metabolitů. Sekundární metabolity mechorostů jsou velice zajímavým a málo prozkoumaným odvětvím. V této práci jsou zahrnuty informace týkající se sekundárních metabolitů mechorostů a jejich analýzy a také možnosti využití izolovaných sekundárních metabolitů. Jsou zde zahrnuty jak začátky výzkumu sekundárních metabolitů od jednoho z prvních izolovaných terpenů, kterým byl marchantin u Marchantia polymorpha, až po dnešní studie, zaměřující se na objev nových sekundárních metabolitů přímo u vybraných zástupců mechorostů a samozřejmě jejich využitelnost v lidské činnosti. Z různých zahraničních publikací bylo potvrzeno, že mechorosty produkují specifické sekundární metabolity, které se nacházejí jen u vybraných mechorostů a ne u vyšších rostlin....
|
|
|
Terpene discovery combining in silico and molecular biology approaches
Smrčková, Helena ; Pluskal, Tomáš (vedoucí práce) ; Hodek, Petr (oponent)
Terpenoidy představují rozsáhlou a chemicky i strukturně rozmanitou skupinu metabolitů, což z nich činí významný zdroj potenciálních terapeutik. Terpenoidy jsou běžně využívány v potravinářství, farmacii, kosmetice či jako paliva. Výchozí látky pro biosyntézu terpenů jsou kondenzované a v některých případech cyklické uhlovodíky syntetizované z lineárních isoprenyl pyrofosfátů enzymy terpensynthasami. Tato rozsáhlá proteinová rodina sdílí společné motivy a domény určující funkci, které lze použít jako matrici pro hledání homologů mezi proteiny s dosud neznámou funkcí. Potenciál necharakterizovaných proteinů produkovat dosud nepopsané terpenové struktury byl hodnocen in silico pomocí metody vyvinuté v laboratoři Mgr.Tomáše Pluskala, Ph.D. na Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd ČR. Devět proteinů pocházejících z rostlin, bakterií a hub bylo podrobeno heterologní expresi v upravených kvasinkových kmenech JWY501 a ZX178-08, které nadměrně produkují nezbytné isoprenyl pyrofosfátové prekurzory. Výsledné extrakty kvasinkových kultur byly analyzovány pomocí plynové chromatografie-hmotnostní spektrometrie a kapalinové chromatografie- hmotnostní spektrometrie, přičemž pět z devíti proteinů vykazovalo terpensynthasovou aktivitu. Bylo zjištěno, že dva seskviterpeny produkované houbovým enzymem...
|
|
|
Antiproliferative, antioxidant and anti-inflammatory activity of quinones, terpenoids and their derivatives
Přibylová, Marie ; Vaněk, Tomáš (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent) ; Hájek, Miroslav (oponent)
Přírodní látky hrají v medicíně důležitou roli. Jsou zdrojem nových léčiv nebo slouží jako inspirace pro jejich vývoj. Tato práce se zabývá přípravou derivátů a studiem biologických aktivit dvou skupin přírodních látek, chinonů a terpenoidů. Terpenoidy jsou rostlinné sekundární metabolity, které jsou známé pro antimikrobiální, protizánětlivou a protinádorovou aktivitu. Zaměřili jsme se na dva zástupce, paklitaxel a karvakrol. Byly připraveny konjugáty paklitaxelu s analogy hormonu GnRH, potenciálně vhodné pro cílené směrování cytostatika do nádorových buněk. Jejich antiproliferativní účinek in vitro byl vyhodnocen na nádorové buněčné linii MCF-7 a cytotoxicita v potkanních hepatocytech. U karvakrolu a jeho derivátu byla testována protizánětlivá aktivita in vitro jako schopnost těchto látek inhibovat syntézu prostaglandinu E2 cyklooxygenázovou cestou. Chinony, které byly dalším cílem disertační práce, jsou známé pro podobné biologické účinky jako terpenoidy. Thymochinon, juglon a jejich deriváty byly testovány in vitro jako inhibitory cyklooxygenáz a 5-lipoxygenázy. Byly připraveny deriváty juglonu, které pomohly objasnit vztah mezi protizánětlivou aktivitou in vitro a strukturou této látky. U thymochinonu a jeho derivátů byla sledována antioxidační kapacita DPPH a ORAC testem, jako schopnost těchto látek...
|
|
|
Biochemické aspekty studia a restaurování starých výtvarných děl
Hradilová, Iveta ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent)
Každá část uměleckého díla se postupem času mění. Dokonce i souběžně s jeho vytvářením, když tempera nebo olejová barva vysychá. Již tento děj je biochemickou změnou materiálu. Předmětem bakalářské práce je přehledné shrnutí dosavadních znalostí o pryskyřicích a proteinových pojivech používaných ve výtvarných dílech. A to nejen z hlediska jejich složení, ale především se zaměřením na jejich proměny v čase, které se s nimi mohou stát od nanesení na plátno, dřevo, kovový podklad či papír až po nenávratné zničení. Poslední část práce je věnována biologické degradaci (působení bakterií, kvasinek, plísní atd.) Klíčová slova: pryskyřice, terpenoidy, proteinová pojiva, degradace, oxidace, hydrolýza
|
|
|
Antiproliferative, antioxidant and anti-inflammatory activity of quinones, terpenoids and their derivatives
Přibylová, Marie ; Vaněk, Tomáš (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent) ; Hájek, Miroslav (oponent)
Přírodní látky hrají v medicíně důležitou roli. Jsou zdrojem nových léčiv nebo slouží jako inspirace pro jejich vývoj. Tato práce se zabývá přípravou derivátů a studiem biologických aktivit dvou skupin přírodních látek, chinonů a terpenoidů. Terpenoidy jsou rostlinné sekundární metabolity, které jsou známé pro antimikrobiální, protizánětlivou a protinádorovou aktivitu. Zaměřili jsme se na dva zástupce, paklitaxel a karvakrol. Byly připraveny konjugáty paklitaxelu s analogy hormonu GnRH, potenciálně vhodné pro cílené směrování cytostatika do nádorových buněk. Jejich antiproliferativní účinek in vitro byl vyhodnocen na nádorové buněčné linii MCF-7 a cytotoxicita v potkanních hepatocytech. U karvakrolu a jeho derivátu byla testována protizánětlivá aktivita in vitro jako schopnost těchto látek inhibovat syntézu prostaglandinu E2 cyklooxygenázovou cestou. Chinony, které byly dalším cílem disertační práce, jsou známé pro podobné biologické účinky jako terpenoidy. Thymochinon, juglon a jejich deriváty byly testovány in vitro jako inhibitory cyklooxygenáz a 5-lipoxygenázy. Byly připraveny deriváty juglonu, které pomohly objasnit vztah mezi protizánětlivou aktivitou in vitro a strukturou této látky. U thymochinonu a jeho derivátů byla sledována antioxidační kapacita DPPH a ORAC testem, jako schopnost těchto látek...
|
|
|
Biochemické aspekty studia a restaurování starých výtvarných děl
Hradilová, Iveta ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Smrček, Stanislav (oponent)
Každá část uměleckého díla se postupem času mění. Dokonce i souběžně s jeho vytvářením, když tempera nebo olejová barva vysychá. Již tento děj je biochemickou změnou materiálu. Předmětem bakalářské práce je přehledné shrnutí dosavadních znalostí o pryskyřicích a proteinových pojivech používaných ve výtvarných dílech. A to nejen z hlediska jejich složení, ale především se zaměřením na jejich proměny v čase, které se s nimi mohou stát od nanesení na plátno, dřevo, kovový podklad či papír až po nenávratné zničení. Poslední část práce je věnována biologické degradaci (působení bakterií, kvasinek, plísní atd.) Klíčová slova: pryskyřice, terpenoidy, proteinová pojiva, degradace, oxidace, hydrolýza
|
|
|
Epifytické druhy skupiny Lecanora subfusca v České republice
Malíček, Jiří ; Palice, Zdeněk (vedoucí práce) ; Guttová, Anna (oponent)
- 3 - ABSTRAKT Během revize epifytických zástupců skupiny Lecanora subfusca v České republice bylo zaznamenáno celkem devět taxonů. L. cinereofusca a L. exspersa jsou uváděny vůbec poprvé. Výskyt L. circumborealis byl naopak na našem území vyloučen. Druhy L. cinereofusca a L. horiza lze považovat za vyhynulé. Nejběžnějším druhem je L. pulicaris. Taxony L. rugosella a L. subrugosa považuji pouze za extrémní formy od L. chlarotera a L. argentata. Tyto morfotypy jsou podmíněny ekologicky: substrátem (úživná borka) a stanovištěm (vliv eutrofizace). V případě L. subrugosa tuto domněnku potvrdila také molekulární data (sekvence ITS rDNA). Podrobný průzkum sekundárních metabolitů pomocí tenkovrstevné chromatografie odhalil řadu nových látek ze skupiny terpenoidů, z nichž prakticky všechny mají taxonomický význam. Během studia změn v rozšíření jednotlivých druhů byl zaznamenán ústup druhů L. allophana a L. chlarotera ve srovnání s minulostí. Naopak L. pulicaris je nyní zřejmě hojnější. Hlavními důvody jsou znečištění ovzduší a acidifikace substrátů vlivem kyselých dešťů. Výrazné okyselení borky dřevin bylo prokázáno na příkladu L. pulicaris. Tento lišejník dříve rostl převážně na dřevinách s kyselou borkou. Vlivem acidifikace se však přesunul na stromy, které mají na normálních podmínek mírně kyselou až...
|
|
|
Aplikace geochemické analýzy ve výzkumu chemických fosilií
Havelcová, Martina ; Sýkorová, Ivana ; Trejtnarová, Hana
Biomarkery (také nazývané chemické fosilie) jsou specifické organické sloučeniny přítomné v geologických materiálech, které jsou pozůstatky biochemických prekurzorů, přeměněné redukčními nebo oxidačními procesy. Chemické struktury těchto biologických ukazatelů mohou být vztaženy zpět k původním sloučeninám a využity jako indikátory biogenních, paleoenvironmentálních a geochemických dějů. Příklady identifikovaných biomarkerů v několika studovaných uhlích, sedimentech a zbytcích fosilních dřev jsou prezentovány.
|
host ::
RSS.